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Paralleles Rechnen Seminar

Instructors: Univ-Prof. Dr. Bertil Schmidt
Shortname: 08.079.22590
Course No.: 08.079.22590
Course Type: Seminar

Requirements / organisational issues

Die Platzvergabe erfolgt erst nach Ende der Anmeldeohase und NICHT nach dem First-Come-First-Serve-Prinzip!

Voraussetzungen:
Erfolgreiche vorherige Teilnahme an HPC oder Accelerated Computing with GPUs ist Voraussetzung zur Teilnahme.

Themenauswahl:
E-Mail mit 2 bevorzugten Themen bis spätestens 1.7.2022 an Prof. Dr. Bertil Schmidt per E-Mail schicken. Ich werde daraufhin Ihnen ein Thema zuweisen. Es ist auch möglich eigenen Themen vorzuschlagen

Mögliche Themen:

• BWA-MEM-SCALE: Accelerating Genome Sequence Mapping on Commodity Servers
  
• Variant Calling Parallelization on Processor-in-Memory Architecture
  
• Demeter: A Fast and Energy-Efficient Food Profiler using Hyperdimensional Computing
  
• KrakenOnMem: a memristor-augmented HW/SW framework for taxonomic profiling
  
• A SIMD algorithm for the detection of epistatic interactions of any order
  
• Accelerating Lattice QCD Multigrid on GPUs Using Fine-Grained Parallelization
  
• Unlocking Personalized Healthcare on Modern CPUs/GPUs: Three-way Gene Interaction Study
  
• Systolic Computing on GPUs for Productive Performance
  
• Revisiting Huffman Coding: Toward Extreme Performance on Modern GPUs
  
• HashGraph—Scalable Hash Tables Using a Sparse Graph Data Structure
  
• Dense dynamic blocks: optimizing SpMM for processors with vector and matrix units using machine learning techniques
  
• Toward accelerated stencil computation by adapting tensor core unit on GPU
  
• Selber vorgeschlagenes Thema (muss aber von mir genehmigt werden)